MPD Psycho kể về Yosuke Kobayashi, một thám tử mắc rối loạn đa nhân cách. Sau khi vợ anh bị sát hại, nhân cách “Kobayashi hiền lành” biến mất và thay vào đó là Amamiya, một nhân cách lạnh lùng, logic và tàn nhẫn.Trong khi điều tra các vụ án kỳ dị, anh phát hiện chúng liên quan đến một tổ chức bí ẩn thực hiện thí nghiệm trên người để tạo ra “nhân cách nhân tạo”. Các hung thủ trong những vụ án đều có điểm chung: được cấy một loại mã code khiến họ bị điều khiển hoặc đánh thức nhân cách bạo lực bên trong