Đứa con của thời tiết kể về Hodaka, một cậu thiếu niên bỏ nhà lên Tokyo giữa những ngày mưa bất tận, nơi cậu gặp Hina – cô gái có khả năng đặc biệt khiến bầu trời quang đãng chỉ bằng lời cầu nguyện. Hai người nương tựa vào nhau để mưu sinh, dùng năng lực của Hina mang lại nắng ấm cho mọi người, nhưng dần nhận ra mỗi điều ước đều có cái giá phải trả. Khi thiên nhiên đòi lại sự cân bằng, Hodaka buộc phải lựa chọn giữa trật tự của thế giới và hạnh phúc của người mình yêu, mở ra câu chuyện cảm động về tình yêu tuổi trẻ, sự hy sinh và quyền được lựa chọn số phận của chính mình.